Genetyczne powiązania ze zwapnieniami zastawek i zwężeniem zastawki aortalnej AD 3

W naszych analizach stężenia Lp (a) uwarunkowane genetycznie (zgodnie z przewidywaniami liczby kopii SNP LPA) uległy regresji wobec obecności zwapnień zastawki aortalnej. Dwustopniowy estymator wariancji Murphy-Topela zastosowano do obliczenia 95% przedziałów ufności. Wyniki poszczególnych badań zostały następnie połączone z zastosowaniem metaanalizy efektów losowych o odwrotnym współczynniku wariancji, ze względu na heterogeniczność w poszczególnych kohortach. Pełne szczegóły analizy statystycznej znajdują się w dodatkowym dodatku. Wyniki
Populacje wykrywania i replikacji
Wyjściowa charakterystyka uczestników etapu odkrywania, z których wszyscy byli białymi Europejczykami, została przedstawiona w Tabeli 1; dane zostały zawarte od 1298 uczestników w FHS, 3120 w AGES-RS i 2527 w MESA. Dane dotyczące zwapnienia zastawki aortalnej były dostępne dla 6942 uczestników w trzech kohortach, a dane dotyczące zwapnienia pierścienia mitralnego były dostępne dla 3795 uczestników w kohortach FHS i MESA. Etap replikacji obejmował dane od 745 uczestników w HNR i od nieeuropejskich grup etnicznych z rodziny MESA i MESA (2497 Amerykanów pochodzenia afrykańskiego, 774 Chińskich Amerykanów i 2027 Hiszpańskich Amerykanów). Ponadto, z wykorzystaniem danych z 28 193 uczestników MDCS i 10 400 uczestników CCHS, ocenialiśmy, czy SNP najsilniej związane z zwapnieniem zastawki aortalnej również wiązało się z przypadkowym zwężeniem zastawki aortalnej.
W próbie odkrycia zaobserwowany rozkład wartości P dla korelacji SNP z dwoma fenotypami zastawkowymi odpowiadał spodziewanemu rozkładowi (patrz wykresy kwantowania kwantyli na Rys. S1A i S1B w Dodatkowym dodatku), z niewielkim nadmiarem znaczących wspomnienia. To odkrycie sugeruje, że ani artefakt genotypowania, ani systematyczne różnice w częstości alleli ze względu na grupę etniczną (tj. Stratyfikacja populacji) nie spowodowały istotnego błędu w analizie.
SNPs związany ze zwapnieniem zastawki aortalnej
Ryc. 1. Ryc. 1. Powiązania pomiędzy każdym polimorfizmem pojedynczego nukleotydu (SNP) a zaworem aortalnym – wapniem lub pierścieniem Mitralną wapnia, zgodnie z pozycją chromosomową. Wykresy na Manhattanie pokazują, że pojedynczy SNP na chromosomie 6 (rs10455872) ma znaczenie dla worteksu aortalnego wapnia (P = 9,0 × 10-10) (panel A) i że dwa SNP na chromosomie 2 (rs17659543 i rs13415097) mają znaczenie dla genomu mitralny wapń pierścieniowy (P = 1,5 x 10-8 i P = 1,8 x 10-8, odpowiednio) (panel B). X na osi X w każdym panelu wskazuje chromosom X-X.
Tabela 2. Tabela 2. Znaczące związki genomewidu polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP) z zaworem aortalnym i pierścieniem Mitral. Tabela 3. Tabela 3. SNP rs10455872 w LPA i jego powiązanie z wapniem zastawki aortalnej u białych Europejczyków w kohortach do wykrywania i replikacji. Zidentyfikowaliśmy jeden SNP związany z zwapnieniem zastawki aortalnej przy wartości P mniejszej niż 5,0 x 10-8, przekraczając nasz wcześniej określony próg istotności dla genomu. Ten SNP, rs10455872, znajduje się w intronie 25 LPA na chromosomie 6 (figura 1A i fig. S2A w dodatkowym dodatku). Po korektach dotyczących wieku i płci uczestników, allel ryzyka (G) był powiązany z szansą na zwapnienie zastawki aortalnej, która została zwiększona o współczynnik 2 (iloraz szans, 2,05; P = 9,0 × 10-10) (tabela 2) . Kierunek działania dla allelu ryzyka był spójny – i podobnej wielkości – we wszystkich kohortach etapu odkrywania (Tabela 3). Te wyniki z użyciem imputowanych SNP zostały potwierdzone, gdy przeanalizowano bezpośrednie, gęsto genotypowane dane SNP, które były dostępne w FHS i MESA; powiązania pomiędzy SNP a zwapnieniem zastawki aortalnej były silniejsze, gdy wykorzystano dane z bezpośrednio genotypowanych SNPs niż gdy przypisane SNPs zostały użyte w tej samej próbce populacji (FHS: iloraz szans, 2,41; P = 1,8 × 10-5; MESA: iloraz szans, 1,93; P = 2,6 × 10-4). Łącznie 44 dodatkowe SNP z dowodami sugerującymi skojarzenie (P <1 × 10-5) są wymienione w Tabeli S1 Dodatku Uzupełniającego. Pełny zestaw danych wyników jest dostępny na stronie Framingham Heart Study (www.framinghamheartstudy.org/research/resresults.html).
SNP związane ze zwapnieniem pierścieniowym Mitral
Zidentyfikowaliśmy dwa SNP związane z zwapnieniem pierścienia mitralnego przy wartości P mniejszej niż 5,0×10-8. Te dwa SNP, które są w wysokim sprzęcie nierównowagi (tj. Wysoce skorelowane), zostały zidentyfikowane na chromosomie 2 w pobliżu skupienia genów IL1F9 między IL1F7 i IL1F9; są one oznaczone jako rs17659543 (P = 1,5 x 10-8 dla powiązania z pierścieniowym zwapnieniem mitralnym) i rs13415097 (P = 1,8 × 10-8) (ryc. 1B i tabela 2 oraz ryc.
[więcej w: Stomatolog Ursynów, stomatologia katowice, leczenie endometriozy ]
[hasła pokrewne: stomatolog pruszków, klinika w białymstoku, wypełnianie zmarszczek kraków ]